Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» icon

Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины»



НазваниеСнипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины»
Дата конвертации27.08.2012
Размер22.76 Kb.
ТипДокументы

СНИПЫ В ТРЕТЬЕМ ПОЛОЖЕНИИ КОДОНОВ ПРАКТИЧЕСКИ НЕ ВСТРЕЧАЮТСЯ В ГЕНАХ, ДЕТЕРМИНИРУЮЩИХ МУТАНТНЫЕ БЕЛКИ

В.В. Соколик

ГУ «Институт неврологии, психиатрии и наркологии АМН Украины», г. Харьков, Украина; sokolik67@rambler.ru


Теория накопления мутаций (Mutations accumulation theory) в качестве предпосылок возникновения старения организма предусматривает увеличение с возрастом частоты генетических мутаций, которые остаются в генофонде популяции. Поэтому особый интерес представляют снипы – single nucleotide polymorphism (SNP) в генах белков, агрегация которых обусловливает основные возраст-зависимые конформационные болезни. Речь идёт о β-амилоидном пептиде (болезнь Альцгеймера), α-синуклеине (болезнь Паркинсона) и хантингтоне (хорея Хантингтона).

Цель работы состояла в выявлении причин специфического распределения SNP между нуклеотидами триплетов в нуклеотидных последовательностях, детерминирующих эти белки.

В Protein Data Bank присутствует информация о всех известных в настоящее время мутациях для изучаемых белков (файлы UniProtKB/Swiss-Prot P05067 (A4_HUMAN), P37840 (SYUA_HUMAN) и P42858 (HD_HUMAN)). Обращает на себя внимание, что снипы в кодонах генов известных мутантных белков распределяются преимущественно в дуплете первых двух нуклеотидов триплета, ответственных за вариант аминокислотного остатка, и практически не встречаются в третьем нуклеотиде, что говорит о ведущей роли этого нуклеотида в обеспечении функциональности белка и жизнеспособности организма в целом.

При обсуждении аминокислотной последовательности белка из представления о его первичной структуре невольно ускользает рассмотрение пептидных связей между аминокислотными остатками. Введение понятия конфигурации пептидной связи (КПС) в качестве основного, кодируемого в геноме третьим нуклеотидом кодонов, элемента пространственной структуры белка решает эту проблему. Правая (R), нулевая (0) и левая (L) конфигурации пептидной связи образуют ротамерные варианты в композиции смежных аминокислотных остатков. При этом повторение в полипептиде R-конфигурации пептидной связи заставляет его аминокислотную цепочку сворачиваться в правую спираль без какого-либо дополнительного участия боковых цепей аминокислотных остатков; повторение 0-конфигурации – в β-тяж, а повторение L-конфигурации – в левую спираль. Чередование R, 0 и L-конфигураций пептидных связей обусловливает неупорядоченный участок аминокислотной цепи.

Автором данного исследования была составлена ^ таблица генетического кода пространственной структуры белка, использование которой дало возможность по детерминирующей нуклеотидной последовательности построить структурные шаблоны, а также декодировать положение фрагментов вторичной структуры интересующих нас белков.
Показали, что мутации не могут оказывать влияние на пространственную структуру белков: они лишь влияют на адекватное функционирование этих белков. Локальное изменение пространственной структуры белка, вызванное SNP в третьем положении триплета нуклеотидов, привело бы к изменению конфигурации пептидной связи в композиции смежных аминокислотных остатков и повлекло бы за собой необратимую инактивацию белка. Кроме этого, мутантные формы рассмотренных в данном исследовании белков приобретают не свойственную им повышенную способность к агрегации, что и является причиной таких медленно развивающихся наследственных патологий накопления, как болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона или хорея Хантингтона.




Похожие:

Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconВ. В. Соколик, к б. н., с н. с. Гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины»
...
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconПространственная структура гомологов основного актина и ?-актина 1 различна в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины»
Установлена различная пространственная структура для основного актина и ?-актина 1 с 91% идентичностью аминокислотных последовательностей...
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconРоль конформационной патологии в реализующих механизмах старения в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины»
Данный механизм характерен для целого ряда нейродегенеративных заболеваний, клиническое проявление которых совпадает с началом этапа...
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconВ. В. Соколик, канд биол наук, с н. с лаборатории биохимии гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» (г. Харьков) структурные предпосылки агрегации β-амилоидного пептида
Наличие возможных элементов вторичной структуры в β-амилоидном пептиде 1-40(42) изучали используя таблицу генетического кода пространственной...
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconКровотечения
Кабинета Министров Украины; кафедра анестезиологии, реаниматологии и медицины катастроф Национального медицинского университета им....
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconЭкзогенные психические расстройства
...
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconРешение Об отмене решения Седовского поселкового совета от 28. 09. 2009 г
Конституции Украины, ст. 25, ст. 26 Закона Украины «О местном самоуправлении в Украине», ст. 59, п. 3 ст. 62 Земельного Кодекса Украины,...
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconНаучный совет по физиологии человека ан СССР и амн СССР институт физиологии им. И. П. Павлова
Фролькнс В. В., Мурадян X. К. Экспериментальные пути продления жизни. — Л.: Наука, 1988. — 248 с
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconЛабораторное исследование (аназизы) воды. Артезианские скважины: нрбу-97 (п 6 ) санпин 4-171-10: Радионуклиды
Исследования проводятся в лаборатории радиационного мониторинга гу игмэ амн украины. Ответственное лицо – Бузынный Михаил Георгиевич,...
Снипы в третьем положении кодонов практически не встречаются в генах, детерминирующих мутантные белки в. В. Соколик гу «Институт неврологии, психиатрии и наркологии амн украины» iconЛабораторное исследование (аназизы) воды. Артезианские скважины: нрбу-97 (п 6 ) санпин 4-171-10: Радионуклиды
Исследования проводятся в лаборатории радиационного мониторинга гу игмэ амн украины. Ответственное лицо – Бузынный Михаил Георгиевич,...
Разместите кнопку на своём сайте:
Документы


База данных защищена авторским правом ©podelise.ru 2000-2014
При копировании материала обязательно указание активной ссылки открытой для индексации.
обратиться к администрации
Документы

Разработка сайта — Веб студия Адаманов